MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000854	CAG	2	6	158269	158274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600538
3002	NC_000854	TCC	2	6	158298	158303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600538
3003	NC_000854	CTA	2	6	158353	158358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600538
3004	NC_000854	G	6	6	158388	158393	0 %	0 %	100 %	0 %	14600538
3005	NC_000854	CTG	2	6	158459	158464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600538
3006	NC_000854	ACCCT	2	10	158492	158501	20 %	20 %	0 %	60 %	14600539
3007	NC_000854	GGT	2	6	158547	158552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600539
3008	NC_000854	ACC	2	6	158573	158578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600539
3009	NC_000854	AAC	2	6	158588	158593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600539
3010	NC_000854	TGC	2	6	158681	158686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600539
3011	NC_000854	AAC	2	6	158687	158692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600539
3012	NC_000854	TCG	2	6	158826	158831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600539
3013	NC_000854	C	7	7	158855	158861	0 %	0 %	0 %	100 %	14600539
3014	NC_000854	AG	3	6	158883	158888	50 %	0 %	50 %	0 %	14600539
3015	NC_000854	AGC	2	6	159042	159047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600539
3016	NC_000854	ACG	2	6	159072	159077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600539
3017	NC_000854	ACA	2	6	159354	159359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600539
3018	NC_000854	ACCT	2	8	159371	159378	25 %	25 %	0 %	50 %	14600539
3019	NC_000854	GAC	2	6	159440	159445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600539
3020	NC_000854	GCCT	2	8	159454	159461	0 %	25 %	25 %	50 %	14600539
3021	NC_000854	CCT	2	6	159487	159492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600539
3022	NC_000854	TAG	2	6	159506	159511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600539
3023	NC_000854	TTG	2	6	159541	159546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600539
3024	NC_000854	CT	3	6	159565	159570	0 %	50 %	0 %	50 %	14600539
3025	NC_000854	TCC	2	6	159576	159581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600539
3026	NC_000854	CTAG	2	8	159711	159718	25 %	25 %	25 %	25 %	14600539
3027	NC_000854	CCT	2	6	159731	159736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600539
3028	NC_000854	GAG	2	6	159761	159766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600539
3029	NC_000854	TA	3	6	159817	159822	50 %	50 %	0 %	0 %	14600539
3030	NC_000854	GCCG	2	8	159827	159834	0 %	0 %	50 %	50 %	14600539
3031	NC_000854	ATT	2	6	159843	159848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600539
3032	NC_000854	CAG	2	6	159937	159942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600540
3033	NC_000854	AGG	2	6	159968	159973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600540
3034	NC_000854	TAT	2	6	160012	160017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600540
3035	NC_000854	TA	3	6	160039	160044	50 %	50 %	0 %	0 %	14600540
3036	NC_000854	AGG	2	6	160049	160054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600540
3037	NC_000854	AAT	2	6	160071	160076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600540
3038	NC_000854	CT	3	6	160088	160093	0 %	50 %	0 %	50 %	14600540
3039	NC_000854	GCGTCA	2	12	160100	160111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14600540
3040	NC_000854	C	6	6	160116	160121	0 %	0 %	0 %	100 %	14600540
3041	NC_000854	ACT	2	6	160136	160141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600540
3042	NC_000854	TCCC	2	8	160147	160154	0 %	25 %	0 %	75 %	14600540
3043	NC_000854	CT	3	6	160228	160233	0 %	50 %	0 %	50 %	14600540
3044	NC_000854	CTCC	2	8	160317	160324	0 %	25 %	0 %	75 %	14600540
3045	NC_000854	CTGG	2	8	160340	160347	0 %	25 %	50 %	25 %	14600540
3046	NC_000854	CT	3	6	160373	160378	0 %	50 %	0 %	50 %	14600540
3047	NC_000854	C	6	6	160379	160384	0 %	0 %	0 %	100 %	14600540
3048	NC_000854	CCT	2	6	160578	160583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600540
3049	NC_000854	CTA	2	6	160617	160622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600540
3050	NC_000854	GCT	3	9	160627	160635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600540
3051	NC_000854	CGA	2	6	160704	160709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600540
3052	NC_000854	AGG	2	6	160805	160810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600540
3053	NC_000854	AG	3	6	161123	161128	50 %	0 %	50 %	0 %	14600540
3054	NC_000854	AGA	2	6	161161	161166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600540
3055	NC_000854	AGT	2	6	161234	161239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600540
3056	NC_000854	CAC	2	6	161247	161252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600540
3057	NC_000854	CCG	2	6	161272	161277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430940
3058	NC_000854	AGG	2	6	161278	161283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430940
3059	NC_000854	AGCC	2	8	161340	161347	25 %	0 %	25 %	50 %	118430940
3060	NC_000854	AG	3	6	161348	161353	50 %	0 %	50 %	0 %	118430940
3061	NC_000854	AGGAG	2	10	161447	161456	40 %	0 %	60 %	0 %	118430940
3062	NC_000854	CTC	2	6	161668	161673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430941
3063	NC_000854	TG	3	6	161774	161779	0 %	50 %	50 %	0 %	118430941
3064	NC_000854	CT	3	6	161872	161877	0 %	50 %	0 %	50 %	118430941
3065	NC_000854	CCT	2	6	161947	161952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430941
3066	NC_000854	CCT	2	6	162100	162105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430941
3067	NC_000854	CTG	2	6	162114	162119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430941
3068	NC_000854	AAT	2	6	162121	162126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430941
3069	NC_000854	TTC	2	6	162128	162133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430941
3070	NC_000854	TTC	2	6	162182	162187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430941
3071	NC_000854	TA	3	6	162322	162327	50 %	50 %	0 %	0 %	118430941
3072	NC_000854	CGC	2	6	162397	162402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430941
3073	NC_000854	CCA	2	6	162477	162482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430941
3074	NC_000854	CCCTC	2	10	162958	162967	0 %	20 %	0 %	80 %	118430942
3075	NC_000854	GCT	2	6	162992	162997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430942
3076	NC_000854	GGCAG	2	10	163013	163022	20 %	0 %	60 %	20 %	118430942
3077	NC_000854	CTC	2	6	163082	163087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430942
3078	NC_000854	CTC	3	9	163113	163121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430942
3079	NC_000854	GAA	2	6	163148	163153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430942
3080	NC_000854	GA	3	6	163172	163177	50 %	0 %	50 %	0 %	118430942
3081	NC_000854	GCC	2	6	163199	163204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430942
3082	NC_000854	CGG	2	6	163231	163236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430942
3083	NC_000854	GGC	2	6	163386	163391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430942
3084	NC_000854	CCT	2	6	163411	163416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430942
3085	NC_000854	TAC	2	6	163428	163433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430942
3086	NC_000854	GAG	2	6	163464	163469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430942
3087	NC_000854	AGG	2	6	163485	163490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430942
3088	NC_000854	GCCC	2	8	163531	163538	0 %	0 %	25 %	75 %	118430942
3089	NC_000854	TCG	2	6	163582	163587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430942
3090	NC_000854	CGG	2	6	163592	163597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430942
3091	NC_000854	TC	3	6	163737	163742	0 %	50 %	0 %	50 %	118430942
3092	NC_000854	TCC	2	6	163749	163754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430942
3093	NC_000854	GAA	2	6	164059	164064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600545
3094	NC_000854	GAC	2	6	164222	164227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600545
3095	NC_000854	CCT	2	6	164372	164377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600545
3096	NC_000854	AGAACT	2	12	164380	164391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	14600545
3097	NC_000854	AGG	2	6	164396	164401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600545
3098	NC_000854	GGA	2	6	164449	164454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600545
3099	NC_000854	AGC	2	6	164488	164493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600545
3100	NC_000854	CAGC	3	12	164490	164501	25 %	0 %	25 %	50 %	14600545
3101	NC_000854	AAG	3	9	164525	164533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600545
3102	NC_000854	ACG	2	6	164628	164633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600545
3103	NC_000854	TCG	2	6	164652	164657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600545
3104	NC_000854	GAG	2	6	164770	164775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600545
3105	NC_000854	C	6	6	164802	164807	0 %	0 %	0 %	100 %	14600545
3106	NC_000854	AGGC	2	8	164808	164815	25 %	0 %	50 %	25 %	14600545
3107	NC_000854	AGG	2	6	164831	164836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600545
3108	NC_000854	TGA	2	6	164859	164864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600545
3109	NC_000854	GAC	3	9	164867	164875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600545
3110	NC_000854	GTT	2	6	164918	164923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600545
3111	NC_000854	GCA	2	6	164949	164954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600545
3112	NC_000854	TGA	2	6	164982	164987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600545
3113	NC_000854	TA	3	6	165050	165055	50 %	50 %	0 %	0 %	14600545
3114	NC_000854	GCAA	2	8	165062	165069	50 %	0 %	25 %	25 %	14600545
3115	NC_000854	AT	3	6	165124	165129	50 %	50 %	0 %	0 %	118430943
3116	NC_000854	ACG	2	6	165168	165173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430943
3117	NC_000854	GAG	2	6	165180	165185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430943
3118	NC_000854	TCC	2	6	165201	165206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430943
3119	NC_000854	GC	3	6	165404	165409	0 %	0 %	50 %	50 %	118430943
3120	NC_000854	GGC	2	6	165410	165415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430943
3121	NC_000854	TA	3	6	165458	165463	50 %	50 %	0 %	0 %	118430943
3122	NC_000854	AAG	2	6	165467	165472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430943
3123	NC_000854	GGA	2	6	165517	165522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430943
3124	NC_000854	GGGTAA	2	12	165691	165702	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	118430943
3125	NC_000854	AGA	2	6	165751	165756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430943
3126	NC_000854	GTA	2	6	165806	165811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430943
3127	NC_000854	AGG	2	6	165905	165910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430943
3128	NC_000854	GAG	2	6	165937	165942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430944
3129	NC_000854	TAA	2	6	165944	165949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430944
3130	NC_000854	AGG	2	6	166018	166023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430944
3131	NC_000854	CGC	2	6	166103	166108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430944
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3133	NC_000854	AGG	2	6	166404	166409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430945
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3136	NC_000854	CT	3	6	166480	166485	0 %	50 %	0 %	50 %	118430945
3137	NC_000854	GAA	2	6	166497	166502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430945
3138	NC_000854	CT	3	6	166524	166529	0 %	50 %	0 %	50 %	118430945
3139	NC_000854	GAG	2	6	166557	166562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430945
3140	NC_000854	GCCGC	2	10	166594	166603	0 %	0 %	40 %	60 %	118430945
3141	NC_000854	CTT	2	6	166707	166712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430945
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3145	NC_000854	GAG	2	6	166827	166832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430945
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3149	NC_000854	GGA	2	6	166963	166968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430945
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3154	NC_000854	ACTC	2	8	167252	167259	25 %	25 %	0 %	50 %	118430945
3155	NC_000854	CCT	2	6	167294	167299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430945
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3159	NC_000854	CTCC	2	8	167531	167538	0 %	25 %	0 %	75 %	14600549
3160	NC_000854	CTG	2	6	167552	167557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600549
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3164	NC_000854	CTCC	2	8	167838	167845	0 %	25 %	0 %	75 %	14600549
3165	NC_000854	TCT	2	6	167900	167905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600549
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3200	NC_000854	ACC	2	6	169653	169658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600551
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3230	NC_000854	CTG	2	6	171392	171397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430947
3231	NC_000854	CCCTG	2	10	171407	171416	0 %	20 %	20 %	60 %	118430947
3232	NC_000854	GC	3	6	171588	171593	0 %	0 %	50 %	50 %	118430947
3233	NC_000854	TCC	2	6	171598	171603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430947
3234	NC_000854	TTA	2	6	171650	171655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430947
3235	NC_000854	GAG	3	9	171664	171672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430947
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3239	NC_000854	CTC	3	9	171780	171788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430947
3240	NC_000854	GTAT	2	8	171798	171805	25 %	50 %	25 %	0 %	118430947
3241	NC_000854	CGC	2	6	171812	171817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430947
3242	NC_000854	TGCA	2	8	171845	171852	25 %	25 %	25 %	25 %	118430947
3243	NC_000854	TCC	2	6	171877	171882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430947
3244	NC_000854	CTT	2	6	171903	171908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430947
3245	NC_000854	AT	3	6	171915	171920	50 %	50 %	0 %	0 %	118430947
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3247	NC_000854	C	6	6	172048	172053	0 %	0 %	0 %	100 %	118430947
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3492	NC_000854	TTA	2	6	185283	185288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430957
3493	NC_000854	CT	4	8	185300	185307	0 %	50 %	0 %	50 %	118430957
3494	NC_000854	CCG	2	6	185319	185324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430957
3495	NC_000854	TCC	2	6	185435	185440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430957
3496	NC_000854	GCC	2	6	185441	185446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430957
3497	NC_000854	TAA	2	6	185528	185533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430957
3498	NC_000854	GA	3	6	185554	185559	50 %	0 %	50 %	0 %	118430957
3499	NC_000854	CAA	2	6	185574	185579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430957
3500	NC_000854	CTT	2	6	185623	185628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430957

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